分子人类学 课程计划
第一讲：导论——分子人类学简介与科学方法论
基本内容：
· 什么是分子人类学：学科定义、研究范围与意义
· 分子人类学的分支（古DNA、群体遗传、人类谱系地理学）
· 科学方法论：假设、证据、可重复性与证伪原则
· 如何获取可靠信息：学术数据库、科普文章、网络文章的区别
· 合理使用人工智能工具进行文献检索和信息核验
· 课程考核方式、作业要求与参考文献
思考题：
1. 请举例说明一个你认为“网上流传很广但缺乏科学依据”的人类起源说法，并用科学方法论分析其问题所在。
2. 如果要用AI工具查找“人类走出非洲的时间”，你会如何设计提问步骤来验证答案的真实性？
第二讲：分子人类学的生物学基础知识
基本内容：
· 细胞、染色体、DNA与基因的基本概念
· 核DNA、线粒体DNA（mtDNA）与Y染色体的特点
· 突变：SNP、STR、Indel及其在人类学研究中的应用
· 遗传标记的选取原则：中性演化、谱系信息量
· 中心法则：DNA→RNA→蛋白质（简要介绍）
思考题：
1. 为什么线粒体DNA只能追踪母系祖先，而Y染色体只能追踪父系祖先？
2. 如果两个人有一个共同的父系祖先，他们的Y染色体STR变异会表现出什么特征？
第三讲：生物演化理论与演化树
基本内容：
· 达尔文演化论要点：变异、遗传、选择、适应
· 中性理论与分子钟假说
· 演化树的绘制方法（聚类法、最大似然法、贝叶斯推断）
· 如何读一棵演化树：单系群、姐妹群、根与枝长
· 人类在灵长类演化树中的位置
思考题：
1. 如果某两个人群的Y染色体谱系树上的分支长度较长，这可能意味着什么？
2. 中性理论如何帮助我们估算不同人群的分化时间？
3. 是否能够判断一些人群或物种比另一些更高级？
4. 有没有活化石？
第四讲：族群概念与人类遗传多样性
基本内容：
· “族群”的人类学定义与生物学基础的区别
· 分子人类学如何界定“人群”（population）：基于等位基因频率的聚类
· 种族是生物概念还是社会建构？——从遗传学看人类变异
· 全球遗传多样性分布：非洲内部分化最深，非非洲人群共享部分分支
思考题：
1. 为什么说“不同种族之间的遗传差异小于种族内部的遗传差异”？请举例说明。
2. 如果一个汉族人的Y染色体类型在东南亚人群中也常见，这能说明什么？
第五讲：语言与族群——语言学谱系及其与遗传的关系
基本内容：
· 语言的定义：口头语言与文字的关系
· 语言谱系分类（语系、语族、语支）及其绘制方法
· 全球主要语系：印欧、汉藏、阿尔泰、尼日尔-刚果、南岛等
· 中国的语言分布：汉藏、阿尔泰、南岛、南亚、印欧语系
· “语系-农耕扩张理论”：原始农业的传播往往伴随语言的扩散
思考题：
1. 为什么说“语言树”和“基因树”往往不完全重合？请给出可能的原因。
2. 假如某考古文化（如仰韶文化）的遗传成分出现在今天的汉语和藏语人群中都较高，这支持哪种理论？
第六讲：现代人的起源——走出非洲
基本内容：
· 现代人（Homo sapiens）的界定：解剖学现代人、行为现代人
· 多地区起源说 vs. 晚近非洲起源说（“走出非洲”模型）
· 分子证据：线粒体夏娃和Y染色体亚当的争议与解释
· 走出非洲的时间路线：非洲→近东→南亚→东南亚→澳洲→欧洲→美洲
· 尼安德特人、丹尼索瓦人与现代人的杂交
思考题：
1. “线粒体夏娃”是我们所有现代人的唯一女性祖先吗？为什么说她生活在约20万年前，而同时代还有别的女性？
2. 如果一个人有2%的尼安德特人基因，这是否意味着他的曾曾曾……祖父母中有一位是尼安德特人？为什么？
第七讲：父系与母系谱系——Y染色体和线粒体谱系树
基本内容：
· Y染色体单倍群的命名与全球分布
· 线粒体单倍群的命名与全球分布
· 如何计算谱系分化年代（分子钟校准、突变率）
· 中国人群的主要单倍群
思考题：
1. 为何Y染色体单倍群与语系经常有较好关联？
2. 如果一个中国北方汉族男性的Y单倍群是C，这可能提示他有什么样的祖先背景？
第八讲：古DNA技术与古人类
基本内容：
· 古DNA的提取、测序与真实性检验（污染控制、降解特征）
· 尼安德特人基因组：与现代人杂交的时段与比例
· 丹尼索瓦人：仅由古DNA发现的古人类，其基因贡献于藏族（EPAS1高原适应基因）
· 其他古人类：佛罗勒斯人、吕宋人、马坝人等
· 古DNA技术带来的革命：推翻“纯粹替代”模型，确认杂交普遍存在
思考题：
1. 古DNA研究如何改变了我们对“现代人走出非洲后完全取代了当地古人类”的认识？
2. 为什么说藏族的高原适应基因（EPAS1）来源于丹尼索瓦人？这有什么进化意义？
第九讲：群体遗传学基础与分子人类学常用方法
基本内容：
· 哈代-温伯格平衡、基因流、遗传漂变
· 有效群体大小与连锁不平衡
· Fst（群体间遗传分化指数）的计算与解释
· PCA（主成分分析）和ADMIXTURE（祖先成分分析）的应用示例
· 采样伦理：口腔拭子采集注意事项、知情同意和隐私保护
思考题：
1. 如果两个人群的Fst值为0.03，这代表分化程度大还是小？能否据此认为他们属于不同“种族”？
2. 为何在进行人群遗传学研究时要特别重视知情同意和隐私保护？
第十讲：人类对环境的适应——基因与表型
基本内容：
· 自然选择与性选择、人工选择（文化选择）的区别
· 人类适应环境的经典案例：
o 肤色（深色皮肤保护叶酸/浅色皮肤合成维生素D）
o 乳糖耐受（LCT基因突变与牧民文化）
o 高原适应（EPAS1、EGLN1等）
o 酒精代谢（ALDH2*2等位基因的分布与农业起源关系）
o 血红蛋白、镰刀性贫血症与地中海贫血、疟疾
思考题：
1. 为什么东亚人群酒精代谢能力普遍较差（喝酒脸红）？这与历史上农业的扩散有什么可能联系？
2. 如果一个人有藏族血统并在平原地区长大，他的EPAS1基因还能帮助他适应高原吗？
第十一讲：从分子人类学看世界历史（上）——西部欧亚与美洲
基本内容：
· 欧洲人群的形成：狩猎采集者→早期农民（安纳托利亚）→颜那亚牧民（印欧语系扩张）
· 美洲原住民的起源：路线及年代
· 末次冰盛期对欧洲人群的影响（狩猎采集者向南退缩，后期重新扩散）
· 大洋洲原住民：澳大利亚-新几内亚的早期扩散（约5万年前）
思考题：
1. 颜那亚文化人群的Y染色体主要是R1a和R1b，这与欧洲语言变迁有何关联？
2. 波利尼西亚人为何父系很大比例以美拉尼西亚来源为主，而母系源于东亚？
第十二讲：从分子人类学看世界历史（下）——东部欧亚与中华民族的形成
基本内容：
· 东亚人群的遗传结构：北方-南方分化与农业扩张
· 汉藏语系的起源：黄河流域的粟作农业人群扩张
· 汉族形成的历史过程：北方源头、南迁融合、局部替代
· 回族的组成：东方与西方成分各自的来源及比例
· 日本人的形成：绳文人（古东亚/东南亚成分）+ 弥生人（来自朝鲜半岛的农业人群）
思考题：
1. “汉族”在遗传上是一个均一的群体吗？如果不是，其南北差异主要形成于什么历史过程？
2. 请根据分子人类学证据，解释“中华民族多元一体”的科学内涵。
第十三讲：人口与性别历史——父系、母系与社会结构
基本内容：
· Y染色体 vs. 线粒体DNA的“有效群体大小”差异及其社会含义
· 历史时期的性别偏向迁徙：战争与贸易中的男性、女性流动模式
· “是否存在母系社会？”：从遗传学和民族志双重证据看母系社会（如摩梭人、纳西族）
· 一夫多妻制在遗传上的痕迹：Y染色体多样性远低于mtDNA多样性
思考题：
1. 为什么在全球范围内，Y染色体的谱系多样性通常低于线粒体DNA？这主要反映什么社会现象？
2. 从遗传学角度看，摩梭人的“走婚”制度会留下什么样的遗传印记？如何检验？
第十四讲：分子考古学前沿进展与热点争议
基本内容：
· 近年古DNA重要发现：
o 欧洲晚冰期至新石器时代的人群更替
o 中国北方新石器时代古DNA（仰韶、龙山、石峁等）
o 印欧语系起源的草原假说获得古DNA支持
o 东南亚的狩猎采集者与农民的取代
· 争议话题：古DNA能否推断语言归属？
· 新技术：古蛋白质组学
思考题：
1. 什么情况下应当使用古蛋白质组学？
2. 你认为古DNA研究结果是否应该用于界定现代民族的身份？为什么？
第十五讲：课程总结与小组汇报
基本内容：
· 学生分组展示“分子人类学视角下的人群案例研究”（如：客家源流、满族与锡伯族的关系、新疆人群遗传组成等）
· 课程核心知识回顾：科学方法论→谱系树→走出非洲→环境适应→中华民族形成→前沿进展
· 自由问答与讨论
思考题（作为汇报引导）：
1. 你所选案例中，分子人类学证据与其他学科（考古、语言、历史）证据是否一致？如有矛盾，可能原因是什么？
2. 你如何向一位不了解分子人类学的朋友介绍“为什么DNA不能决定你的民族认同”？
教学形式
l 课堂讲授：约85%（含多媒体课件、演化树绘制演示、古DNA案例）
l 实践环节：约15%（口腔采样演示、文献查询练习、小组汇报）
考核方式
l 出勤（10%）：出勤记录，抽查或按系统记录
l 课堂或课下回答问题（20%）：课堂或课程群中主动提问/回答，质量高的可获额外加分
l 期末开卷考试（70%）：选择题50分，简答题20分。允许携带纸质参考文献（但不得携带电子设备）
参考书目
l 戴维·赖克. 《人类起源的故事》. 叶凯雄 等译. 浙江教育出版社，2019年。
l 近期各杂志上关于古DNA的论文（具体篇目随学期更新）
